Nuvarande långhus, kor och sakristia är uppförda i mitten av 1200-talet. Tornet byggdes i början av 1200-talet, och hörde till en tidigare, romansk kyrka uppförd omkring 1200.
Utanför Hejnum kyrka står en gravhäll från 1300-talet (G 242), med följande text i runor: ”Gairvat från Norrby vilar här och hans hustru Rudiaud. Gören väl och bedjen för dem. De voro det som ni ären nu och ni bliven det som de äro nu.” Stenskivan bredvid är inte vilken diskbänksskiva som helst, utan en medeltida altarskiva. Det fyrkantiga hålet är en relikgömma, och troligen har skivan hört till ett sidoaltare i långhuset. Någon gång i tiden togs sidoaltaret bort, och stenskivan fick bli trappsten utanför norra långhusportalen. På tal om återanvändning av run- och bildstenar i kyrkobyggen… Inmurad i väggen sitter en relief från en äldre, romansk kyrka uppförd omkring 1200.
